再看崇祯十二年的大明东南，同郑森刚刚返回大明之时已经大有不同，一切都始于1633年那一场同荷兰人的海战，史称料罗湾海战。
　　彼时的荷兰，自1588年荷兰脱离西班牙独立之后，经历了几十年的发展，正处于他作为海上马车夫最辉煌的时代。
　　荷兰开始在全世界各地建立大量的殖民地和贸易据点，其中也包括小琉球岛，还有郑森念念不忘的马六甲，余者不计其数，只把荷兰看做再往后的英国便是了。
　　荷兰的商船数目超过欧洲所有国家商船数目总和，全世界共有2万艘船，荷兰有1.5万艘，比英，法，德诸国船只的总数还多，1602年建立的荷兰东印度公司已经拥有15000个分支机构，贸易额占到全世界总贸易额的一半。
　　再看彼时的大明，且不论东北与西北如何惨烈，大明东南的手工业处于历史的高峰，丝绸、瓷器、茶叶等等，这些个独一份的天朝特产，贩卖到欧洲哪一个不是十倍、百倍的利润，全世界每年所产白银的三分之一流入大明。
　　是时，大明海禁尚未完全放开，荷兰人同大明的一切交易，皆经有郑芝龙手，交易多少皆由郑芝龙决定，这让当时身为海上霸主的荷兰人很不满。
　　再加上郑芝龙的老朋友、老好人熊文灿调任去了广东，刚刚上任福建巡抚的邹维琏对于郑芝龙等人无视海禁令进行贸易多有不满，因此再次发布海禁令，只允许有许可令的福建人民下海活动，但不允许外国人至福建贸易。
　　荷兰人很不满大明的海关政策，于是决定以劫掠的方式胁迫大明修改自己的海禁策略，。
　　七月，新任荷兰台湾长官普特曼斯率领以密德堡号为旗舰的十三艘荷兰战舰，以突然袭击的方式对明朝管辖的南澳发起了进攻大明守备给与还击，双方互有伤亡，荷兰人劫掠一番离去。
　　而后荷兰舰队来到厦门，此时南澳战斗的消息尚未传来，明军厦门守将张永产正在泉州操办器械，郑芝龙也正在率主力部队在福宁剿匪。荷兰舰队对厦门港内的明军战舰发动突袭，击沉二十余艘大型战船及十五艘小型战船。偷袭得手后，荷兰人封锁了厦门湾，马嘴湾，修书与明廷，提出停战条件：
　　一是希望拥有在漳州河、安海、小琉球、巴达维亚自由贸易的权利；
　　二是在荷兰要在鼓浪屿建立贸易据点；
　　三是荷兰可派遣代表至中国沿海城市收购商品。
　　四是荷兰船只能在福建沿海自由停泊；
　　五是不准任何中国船只前往马尼拉；
　　六是荷兰人在中国享有与中国同等法律权利。
　　中国方面的答复是：荷兰人先赔偿战争损失，然后退回小琉球，只有这样才有可能谈判的可能。谈不成，于是继续开打。
　　也亏的是大明腰杆子太硬学不来弯腰，没签这种不平等条约，不然后世鞑清所编的“明史”又多了一条劣迹。
　　荷兰舰队将宣战书答复送交明朝代表，明荷双方正式宣战。
　　你要战，我便战，大明的老传统。
　　九月，福建巡抚邹维琏前往福建进行调兵征调福建各地的军队以及民船、物资制造火船，并立悬赏：烧掉荷兰船得二百两赏银，取得一个荷兰人头颅得二百两赏银。
　　作为厦门海战中损失最大的郑芝龙，他拿出自家的钱财，下令但凡参战士兵，一律额外赏银五粮，火船将士每人额外赏银二十两，击沉一艘荷兰战船额外赏银二百两，斩下一个荷兰人的头颅额外赏银五十两。
　　荷军自攻打厦门许久未下，荷军已感受到来及明军和郑芝龙军事压力及悬赏令的恐怖，不得已派遣使者前往刘香处求援，表示愿意提供小琉球、巴达维亚及其它要塞之处给海盗做自由停泊买卖，遂的刘香主力舰队五十艘战船，二者合兵一处。
　　到这时，荷兰人侵犯福建沿海的事情已经传到了京城，传到了本就焦头烂额的崇祯皇帝耳中。
　　崇祯皇帝龙颜大怒，生怕东南再来一次倭患，下令派路振飞为巡按查办，福建巡抚邹维琏接到圣旨，让他不惜一切代价，将荷兰人彻底赶出福建。
　　邹维琏暗叫倒霉，自己上任不久便摊上了这等倒霉事情，眼下北京城里那个主可不是好惹的，一不小心只怕自己的脑袋都保不住了。
　　于是邹维琏任命五虎游击将军郑芝龙为前锋、南路副总兵高应岳左翼、泉南游击张永产右翼、澎湖游击王尚忠为游兵、副总兵刘应宠、参将邓枢为中军，火速寻找荷兰海上主力以求决战。
　　这以后的一段时间里，双方重兵集团互相搜索，互寻战机。十月初，明军得探得荷兰舰队以及海盗舰队藏匿在金门岛南部的料罗湾口，军主力一百五十艘战船悄悄包围了此地，最终的料罗湾之战一触即发。
　　是役：荷兰方共有八艘战船以及刘香部五十搜艘大小帆船，其中和荷兰人战船均是排水量五百吨左右盖伦船，船舷两侧各设置单层十八门十八磅火炮，船头船尾亦各设置两门二十四磅炮。
　　大明有五十艘大型战船近百艘中型战船和一百余艘火船，皆属郑芝龙前锋部，其中五十艘大型战船吃水也将近五百吨，只是船首尾设有一门购自英国的二十四大炮，至于左右船舷处只各设有十八门小型的佛朗机炮，这种炮仿制与葡萄牙人，其射速很快，然射程短、威力小。郑芝龙的战船，无论是大炮的数量、质量皆落了下风，战争便在荷兰人的自以为胜券在握中拉开了帷幕。
　　黎明时分，太阳刚刚升起，蔚蓝天空升起离开大海，郑芝龙部一百五十艘战船悄悄开到了金门岛南部的料罗湾口。港内荷兰舰队发现明军来袭时，也不惊慌，迅速摆开了一个荷兰战舰居中，海盗船四散策应的防御阵形。
　　郑芝龙舰队在料罗湾东南角展开，以五十艘大船为先锋，顺东风采取了两路突击，全部直奔荷兰舰队，只以剩下一百艘中型战船牵制刘香的海盗船。
　　并无试探，双都保持至死亡的克制，及到双方战舰间距不到两百米时，双方船首的大炮同时开始开炮，一时间硝烟弥漫，炮声震天。
　　这种距离双方大炮的命中率都不高，所以无甚损失。
　　过了片刻，双方的船只混到了一起，郑芝龙的旗舰打出旗语，命令所有人不惜一切代价，靠近贼船接舷上船，这正中了荷兰人的下怀。
　　荷兰战舰船舷的十八磅火炮开始炮击，四五艘郑芝龙战船被瞬间击沉，战争形势陡转之下，郑芝龙侧舷的三十六门佛朗机炮只能发射二到四磅的炮弹，对荷兰人的战船造不成多大的伤害，不得已只得调整船身以船首舰一门炮对敌。
　　双方激战正酣之际，郑芝龙部见其部虽损失重大，但对面的荷兰战舰呈现被包围态势，当机立断下令一百余艘火船出击，一时间百余条火船蜂拥而，战局瞬间逆转，荷兰人八艘战舰，其中一艘遭烧毁，一艘遭击沉，一艘遭掳获，其余战舰在受重伤后逃走、
　　因荷兰战舰航速远高于郑芝龙部战舰，郑芝龙不得已只得放任这些已失了战力的战船扬长而去。至于参战的刘香战船五十艘，则全军覆没在了料罗湾。
　　战后，福建巡抚邹维琏奏报朝廷：“计生擒夷众一百一十八名，斩夷级二十颗，焚夷夹版巨舰五只，夺夷夹版巨舰一只，击破夷贼小舟五十余只，夺盔甲、刀剑、罗经、海图等物皆有籍存。而前后铳死夷尸被夷拖去，未能割级者，累累难数，亦不敢叙。”
　　料罗湾大战后，明军乘胜追击，又连续与荷兰人发生小规模海战，一直将荷兰赶出中国沿海。郑芝龙亦死咬刘香不放，“一破之于石尾，再破之于定海，三破之于广河，四破之于白鸽，五破之于大担，六破之于钱澳。”，于崇祯八年，将刘香逼得在决战中自焚溺死。
　　崇祯十二年，荷兰人再度派朗必即里哥率大型战舰九艘骚扰中国沿海，数次击败明朝水师的小型船队，但最终又被郑芝龙遣人携带盛满火药的竹筒泅水攻击，一连焚毁5艘，朗必即里哥大败而回。
　　崇祯十二年冬，因剿贼有功，明廷擢升郑芝龙为福建总兵官，署都督同知，官居一品，负责福建地方全部军务。
　　直到此时，明朝郑芝龙舰队最终夺取了从日本到南海的全部东亚制海权，郑芝龙被称为“闽海王”，此后东南海疆唯郑芝龙是从，来往内外商人皆用郑氏旗号，史载：“每一舶例入两千金，岁入千万计，并筑城于安平”。
　　当时凡航行在东亚地区的船只，都必须花钱购买郑氏的令旗，若无此旗，在东亚海面被拦截的概率超过百分之五十，若在福建沿海，则百分之百被拦截，便是荷兰人也只得冒了日本人的商船购买郑芝龙的令旗。
　　荷兰东印度公司放弃以武力方式解决与中国间的贸易问题，转回与郑芝龙合作的贸易模式，承认了郑芝龙在东海的霸权郑芝龙不计前嫌，郑芝龙则投桃报李，不顾郑森的强烈反对，同时给与了荷兰人远远超过其他国家的尊重，对荷兰人占据小琉球以及在小琉球岛上做的那些肮脏的事情视而不见。
　　于是乎二者又愉快的做起了生意。